Geografiska program utgår från ett specifikt område och är antingen regionala eller internationella så kallade Interreg.
- Interreg Baltic Sea
Interreg Baltic Sea Region är ett transnationellt samarbetsprogram mellan länderna runt Östersjön. Programmets övergripande mål är att stärka territoriell utveckling och samarbete för att verka för en hållbar och innovativ Östersjöregion. Sekretariatet finns i Rostock i Tyskland. Svensk kontaktpunkt är Tillväxtverket.
- Northern Periphery and Arctic
Norra Periferin och Arktis (NPA) är ett transnationellt samarbetsprogram mellan de nordligaste delarna av Europa, Nordatlantiska territorier och europeiska Arktis. Programmet syftar till att främja hållbar utveckling i avlägsna och glest befolkade områden. Sekretariatet finns i Köpenhamn i Danmark. Svensk kontaktpunkt är Region Västerbotten.